在协议离婚过程中，双方可以协商决定将存款留给孩子。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，夫妻共同财产可通过协议处理，因此双方可以签署协议来确保存款留给孩子。为了避免影响财产分割的公平性和孩子的权益，应尽快达成协议。
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协议离婚时，将存款留给孩子的一种常见方式是签订赠与协议或财产分割协议。选择哪种方式需结合双方的意愿、财产的性质以及孩子的需求进行综合考虑。为确保协议的合法有效性，建议咨询专业律师。
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在离婚过程中，处理财产和孩子问题时需特别谨慎。关于财产分割，可通过协商或诉讼解决，通常遵循平等分割的原则，有过错的一方可能会少分。关于孩子的抚养权，会根据孩子的年龄和双方的条件进行判定。协商不成时，可以提起诉讼，法院将依法做出判决。在整个过程中，应注意保护孩子的权益，避免对其造成不良影响。在处理存款留给孩子的问题时，也应遵循以上原则。