校企合作主修多收技能培训费不合理。依据《劳动法》等相关规定，单位不得巧立名目多收费。若多收，可能构成违法，损害学生权益，影响校企合作声誉。
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处理校企合作多收技能培训费，常见方式有协商、投诉、诉讼。应先尝试与校方协商，协商无果可向教育部门投诉，或采取法律途径诉讼解决。
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不合理。处理方式：1.与校方协商，要求退还多收费用；2.若协商无果，向教育部门投诉，并提供证据；3.仍无法解决，可寻求法律援助，提起诉讼，要求赔偿。