农村合作医疗保险已报销的医疗费一般不能退款。从法律角度看，医保报销是基于保险合同关系，一旦报销完成，即视为合同义务履行完毕。除非存在错误报销、欺诈等情形，否则难以要求退款。若出现医保部门主动要求退款或涉及大额错误报销，可能表明问题较严重，应及时咨询专业人士。
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从法律角度，处理农村合作医疗保险已报销医疗费退款的问题，常见方式有：一是申请行政复议或行政诉讼，针对报销决定存在错误或违法情形；二是与医保部门协商，若存在误解或特殊情况，尝试达成和解；三是寻求法律途径，如起诉要求退款，但通常需有充分法律依据。选择时，应评估证据充分性、时间成本及可能结果。
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从法律角度，针对不同情况处理农村合作医疗保险已报销医疗费退款的具体操作如下：1.若发现报销错误，如多报、误报，应首先收集相关证据，如医疗费用清单、报销凭证等，向医保部门提出书面申请，要求更正并退款。2.若医保部门拒绝更正或退款，可考虑申请行政复议或提起行政诉讼，需准备详细的行政复议申请书或行政起诉状，说明报销错误的事实、理由及法律依据。3.若涉及欺诈行为，如伪造医疗费用凭证骗取报销，不仅无法退款，还可能面临法律责任。此时，应积极配合调查，并考虑寻求律师帮助以减轻或免除责任。4.在协商或法律途径中，务必保留所有沟通记录、文件往来等证据，以备不时之需。