可以更正已缴纳的印花税，需按规定程序操作。
分析：根据税法规定，纳税人发现已缴纳的税款有误时，有权向税务机关提出更正申请。对于股权变更采集印花税子税目选错的情况，您应向主管税务机关提交更正申请，并提供相关证明材料，如股权变更合同、税务登记证等，以便税务机关核实并办理更正手续。
提醒：若税务机关拒绝更正或长时间未予处理，表明问题可能较为严重，建议及时寻求专业税务律师的帮助。
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处理方式：
从法律角度看，更正已缴纳的印花税主要有两种方式：一是向税务机关提交更正申请，二是通过法律途径解决争议。
选择方式：
若更正申请手续简单、证据充分，建议首选向税务机关提交更正申请；若税务机关不予更正或处理不当，可考虑通过行政复议或诉讼等法律途径解决争议。
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具体操作：
1. 准备材料：收集股权变更合同、税务登记证、已缴纳的印花税凭证等相关证明材料。
2. 提交申请：向主管税务机关提交更正申请，说明更正理由，并附上相关证明材料。
3. 税务机关审核：税务机关将对您的更正申请进行审核，核实相关情况。
4. 办理更正手续：如审核通过，税务机关将为您办理更正手续，退还多缴税款或补征税款。
5. 法律途径解决：若税务机关不予更正或处理不当，您可考虑通过行政复议或诉讼等法律途径解决争议，需准备好相关证据材料，并咨询专业税务律师的意见。